Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TSPOP30536 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TSPOP30536 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms