Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCAP28676 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCAP28676 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms