Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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