Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms