Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms