Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMLP26374 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMLP26374 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMLP26374 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMLP26374 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMLP26374 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMLP26374 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHMLP26374 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHMLP26374 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHMLP26374 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHMLP26374 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms