Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms