Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DPA1P20036 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms