Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NCF2P19878 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NCF2P19878 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NCF2P19878 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NCF2P19878 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NCF2P19878 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NCF2P19878 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NCF2P19878 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NCF2P19878 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NCF2P19878 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NCF2P19878 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms