Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CTLA4P16410 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CTLA4P16410 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CTLA4P16410 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CTLA4P16410 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CTLA4P16410 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CTLA4P16410 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CTLA4P16410 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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