Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GP1BBP13224 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms