Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms