Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 RAB11FIP1P1-201ENST00000438337 1762 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 C22orf31-201ENST00000216071 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC112907.1-201ENST00000434957 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AP006193.1-201ENST00000440724 485 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 BTF3L4-205ENST00000489308 794 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 PRDM2-214ENST00000505823 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ALDH1L1-AS1-201ENST00000512384 437 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATXN8OSP0DMR3 YY2-201ENST00000429584 2741 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms