Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EIF3JO75822 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EIF3JO75822 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms