Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms