Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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