Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BCKDKO14874 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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