Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3B1O00203 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms