Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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