Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HHLA3Q9XRX5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms