Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms