Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCDHA12Q9UN75 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCDHA12Q9UN75 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms