Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms