Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms