Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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