Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms