Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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SH3BP4Q9P0V3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SH3BP4Q9P0V3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SH3BP4Q9P0V3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SH3BP4Q9P0V3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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