Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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GDE1Q9NZC3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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GDE1Q9NZC3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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GDE1Q9NZC3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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