Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms