Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms