Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN1Q9BY11 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms