Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL6Q9BWW8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms