Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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IFT27Q9BW83 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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IFT27Q9BW83 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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