Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED2Q9BTP6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms