Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRACR2AQ9BSW2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRACR2AQ9BSW2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms