Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms