Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT140Q96RY7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms