Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCZQ96LD1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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