Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIRT1Q96EB6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms