Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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