Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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