Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms