Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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