Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms