Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCD1Q6ZMY3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms