Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LETMD1Q6P1Q0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LETMD1Q6P1Q0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LETMD1Q6P1Q0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LETMD1Q6P1Q0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LETMD1Q6P1Q0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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