Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms