Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCTD16Q68DU8 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCTD16Q68DU8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms