Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms