Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PKDCCQ504Y2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms